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结构生物化学(Structural Biochemistry)

Nanjing University (via Coursera)

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生物化学是当今生命科学领域中发展最为迅速、涉及面最广的基础学科之一,其着眼点在于使用化学、物理学和生物学等方法去研究各类生物分子的结构与功能,在分子水平上阐明生命的本质、原理和规律。如今,生物化学的理论和实验技术已渗透到生命科学的方方面面,它的发展一次又一次地带动了整个生命科学的发展。

生物化学可分为结构生物化学、代谢生物化学和分子生物学三个部分。本课程为第一部分,即结构生物化学,以后还会推出代谢生物化学和分子生物学课程。

结构生物化学的内容可以说是生物化学最基础的部分,有人把这一部分的内容说成是“静态生化”。其主要内容是各种生物分子(氨基酸、核苷酸、蛋白质、核酸、酶、碳水化合物、脂类和激素等)的结构、性质与功能,特别是三类生物大分子——蛋白质、核酸和酶的结构、性质与功能。

学完这一部分,将会为你学好生物化学的另外两个部分,即代谢生物化学和分子生物学打下坚实的基础,也为你学好细胞生物学、遗传学等其他生命科学相关课程创造条件。

先修课程:普通生物学和有机化学

大纲(Syllabus)

第一章 蛋白质的结构与功能(Chapter 1 Structure and Function of Proteins)

1. 氨基酸(Amino acids)

2. 蛋白质氨基酸与非蛋白质氨基酸(Proteinogenic AA & non-protenogenic AA)

3. 疏水氨基酸与亲水氨基酸(Hydrophobic & Hydrophilic AAs)

4. 必需氨基酸与非必需氨基酸(Essential & Non-essential AAs)

5. 氨基酸的英文缩写(Abbreviations for 22 amino acids)

6. 氨基酸的缩合反应(AA Condensation reaction)

7. 氨基酸的手性(Chirality of Amino Acids)

8. 氨基酸的两性解离与等电点(Acid & base dissociation of amino acids and pI)

9. 茚三酮反应(Reaction with Ninhydrin)

10. Sanger反应(Reaction with DNFB)

11. Edman反应(Reaction with PITC)

12. 蛋白质(Proteins)

13. 蛋白质的一级结构(Primary Structure of Proteins)

14. 肽键(Peptide bonds)

15. 蛋白质的二级结构(Secondary Structure of Proteins)

16. α螺旋(The Alpha Helix)

17. β折叠(The Beta-Pleated Sheet)

18. β转角(The Beta Turn)

19. β突起(The Beta Bulge)

20. 蛋白质的三级结构(Tertiary structure of Proteins)

21. 疏水键(Hydrophobic interactions)

22. 模体(Motif)

23. 结构域(Domain)

24. 蛋白质的四级结构(Quaternary Structure of Proteins)

25. 蛋白质的折叠(Protein folding)

26. 天然无折叠蛋白(Natively Unfolded Proteins)

27. Anfinsen实验(Anfinsen’s Experiment)

28. 分子伴侣(Molecular Chaperone)

29. 蛋白质二硫化物异构酶(Protein disulfide isomerase,PDI)

30. 脯氨酰肽酰顺反异构酶(Peptidylprolyl cis-trans isomerase,PPI)

31. 朊病毒(Prions)

32. 蛋白质组(Proteome)

33. 蛋白质的功能(Functions of Proteins)

34. 兼职蛋白(Moonlighting Proteins)

35. 蛋白质结构与功能之间的关系(Structure and function relationships of proteins)

36.α角蛋白(Alpha Keratin)

37.β角蛋白(Beta Keratin)

38.胶原蛋白(Collagen)

39.肌红蛋白与血红蛋白(Myoglobin & Hemoglobin)

40.正协同效应(Positive Cooperativity)

41.波尔效应(Bohr Effect)

42.别构效应(Allosteric effect)

43.HbS

44.HbF"

第二章 核酸的结构与功能(Chapter 2 Structure and ...

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